I Norge er kunnskapen om flaggermus begrenset, og det mangler større studier av kollisjonsomfang ved vindkraftverk. Flaggermus regnes likevel som den mest sårbare artsgruppen ved vindkraftutbygging. Hvordan et vindkraftverk påvirker flaggermus er stedsavhengig og vil variere fra anlegg til anlegg. Derfor er flaggermus ett av temaene som blir grundig belyst i konsekvensutredningene der det er relevant.
Vindkraftverk kan både føre til kollisjoner og tap av viktige leveområder, men risikoen varierer mellom arter (Rydell m.fl. 2010), og geografi. Artsmangfold og bestand er størst i sør, men avtar kraftig nordover – fra 11 arter i Sør-Norge til én (nordflaggermus) i Finnmark. Dette gir store regionale forskjeller i konfliktpotensial når vindkraft skal bygges ut. Derfor må vurderinger av vindkraftens påvirkning rettes mot utvalgte arter og inngå i konsekvensutredninger. Konflikter oppstår særlig ved høye temperaturer og lite vind. For å redusere konsekvensene kan man blant annet unngå utbygging i områder som kan komme i stor konflikt med flaggermus, og innføre driftsrestriksjoner under perioder, sesonger og værforhold med høy flaggermusaktivitet og økt kollisjonsrisiko. Mer info finnes på NVEs nettsider.